Több mint tíz poszt és párhuzamos intézményi feladatkör
A rektori megbízáson kívül Merkely Béla a Városmajori Szív- és Érgyógyászati Klinika igazgatói posztját is betölti, miközben több egyetemi egység irányításáért felel. Hozzá tartozik a klinika kardiológiai, valamint sportorvostani tanszéke, továbbá vezeti a repülő- és űrorvostan tanszéket is.
Mindezek mellett elnökként irányítja a Semmelweis Sportegyesületet, és a Semmelweis Alapítvány kuratóriumának elnöki tisztségét is ellátja. A kutatási projektek kapcsán korábban elmondta, hogy mintegy huszonöt nemzetközi klinikai vizsgálatban vesz részt, amelyek révén tavaly mintegy 600 beteg jutott ingyenesen korszerű kezelésekhez, míg a vizsgálatvezetői státusz révén tizenhét százalékos részesedés illeti meg a szabályzat szerint.
A Magyar Hang korábban azért kezdte vizsgálni a rektor jövedelmét, mert értesülései szerint több mint tíz forrásból kapott kifizetést. Merkely Béla a kérdésekre kezdetben úgy reagált, hogy a jövedelme „szenzitív személyes adat”, az egyetem pedig először megtagadta az adatok kiadását az érdeklődő lapnak. Az egyetemi fizetések körüli viták idején a Budapesti Rendőr-főkapitányság is vizsgálódni kezdett egy olyan cég állami forrásai miatt, amely közvetlenül a családhoz kötődött.
